Analiza Asocjacji Genomewide Choroby Tętnicy Wieńcowej cd

SNP o FPRP mniejszym niż 0,5 (tj. Takim, dla którego szansa prawdziwie pozytywnego powiązania była większa niż 50%), a także SNP w granicach 100 kb w dowolnym kierunku tego SNP, również z wartościami P mniejszymi niż 0,001, były uważane za reprezentujące pojedyncze locus. Następnie przeprowadzono formalne testy replikacyjne takich loci w niemieckim badaniu z użyciem wiodącego SNP (zdefiniowanego jako SNP o najniższym FPRP) dla każdego locus i dostosowania do wielokrotnego testowania. Wartość AP mniejsza niż 0,05 przy zastosowaniu dwustronnego testu trendu Cochran-Armitage została uznana za wskazującą na istotność statystyczną. Analizę haplotypów przeprowadzono na replikowanych loci, jak opisano w dodatkowym dodatku. Moc replikacji w niemieckim badaniu oszacowano dla każdego locus dla ilorazu szans dla zawału mięśnia sercowego wynoszącego 1,25 na allel i skorygowanego poziomu istotności 0,05. Analiza połączona
Wszystkie SNP, które wykazały dowody istotnego związku (P <0,001) z chorobą wieńcową w badaniu WTCCC lub z zawałem mięśnia sercowego w niemieckim badaniu, zostały połączone w celu oceny ich połączonego FPRP. Połączone ilorazy szans dla allelu ryzyka i 95% przedziału ufności zostały obliczone w ramach każdej warstwy, zgodnie z badaniem.
Analiza kandydata na gen
Geny kandydujące zidentyfikowano w sposób opisany w Dodatku Uzupełniającym. W macierzy GeneChip rozróżniliśmy między SNP, które były identyczne z tymi zidentyfikowanymi w poprzednich badaniach, jako wykazujące związek z chorobą wieńcową i SNP, które były w kompletnym lub prawie kompletnym braku sprzężenia z tymi zidentyfikowanymi w poprzednich badaniach, jako wykazujące związek z wieńcową. choroba tętnic. Zastosowaliśmy jedną z dwóch miar nierównowagi sprzężenia – wartość r2 równą 0,8 lub więcej lub współczynnik nierównowagi (D ) 0,9 lub więcej – na podstawie danych z Międzynarodowego Projektu HapMap.12
Frakcje przypadające na populację
Frakcje przypisane populacji zostały oszacowane w niemieckim badaniu z wykorzystaniem ołowiu SNP z każdego z trzech replikowanych loci. Dokonano korekt dotyczących wieku, płci, interakcji między wiekiem i płcią, wyniku badania Potencjalnego Mózgu Sercowo-Krwiowego (PROCAM) i oceny ryzyka Framingham. Dalsze szczegóły podano w Dodatku Uzupełniającym.
Dostęp do danych
Dane WTCCC są dostępne na stronie www.wtccc.org.uk/info/summary_stats.shtml. Dane z niemieckich badań rodzinnych MI są dostępne dla naukowców akademickich w internetowej bazie danych (www.cardiogenics.imbs-luebeck.de).
Wyniki
Charakterystyka uczestników
Tabela 1. Tabela 1. Podstawowa charakterystyka przypadków w badaniu WTCCC i niemieckim badaniu rodziny MI. Zarówno w badaniach WTCCC, jak i niemieckich, osoby badane były młode (średni wiek z pierwszego zdarzenia, około 50 lat) i miały silną rodzinną podstawę do choroby (Tabela 1).
Analiza pierwotna
Rysunek 1. Rysunek 1. Wykresy natężenia sygnału przedstawiające związek polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) z chorobą tętnic wieńcowych lub zawałem mięśnia sercowego w analizie asocjacji genomewidu. Wartości -log P dotyczą asocjacji każdego SNP z chorobą niedokrwienną serca lub zawałem mięśnia sercowego, z dwustronnych testów Cochran-Armitage dla trendu
[przypisy: olx zakopane, ekstrakt z granatu, wojskowa specjalistyczna przychodnia lekarska ]

Ten wpis został opublikowany w kategorii Bez kategorii i oznaczony tagami , , . Dodaj zakładkę do bezpośredniego odnośnika.

0 odpowiedzi na „Analiza Asocjacji Genomewide Choroby Tętnicy Wieńcowej cd

  1. Wiktoria pisze:

    [..] Odniesienie w tekscie do szkolenia dla lekarzy[…]

  2. Paweł pisze:

    Taki sok jest smaczny, a witaminy i enzymy zawarte w nim działają natychmiast

  3. Jigsaw pisze:

    [..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu olejek bhringraj[…]

  4. Old Orange Eyes pisze:

    eczę się na migotanie przedsionków serca

  5. Henryk pisze:

    [..] odnosnik do informacji w naukowej publikacji odnosnie: odchudzanie[…]

  6. Springheel Jack pisze:

    Polecam serdecznie wszystkim lekarzom, zwłaszcza klinicystom